2199年，星際艦隊開拓者們構建的地球網(wǎng)絡護衛(wèi)體系開始蔓延宇宙各處，人類進入虛實轉換的太空時代，女主因父母在星際邊緣基地恐怖襲擊中喪命，回到地球網(wǎng)中的太空訓練學院，結識了各種地球人、變異人、改造人以及阿達克隆人、扎塔外星人等類人生命學員，逐漸發(fā)現(xiàn)多艘太空戰(zhàn)艦或爆炸、或消失，女主逐漸覺醒打開星際傳送門超能力、找到鑰匙打開了2047年星際遷徙計劃時期的冰封魔盒，回憶起百多年前暗殺反星際移民計劃奸商領袖事件，面臨成為救世之主與毀滅化身的艱難選擇，這也是她成為潘多拉代號的存在使命！學員們想成為星艦指揮官，財團們要爭權奪利、收攏超能力人才，剛停戰(zhàn)的外星人監(jiān)視和套取潘多拉情報，克隆人們反抗探索者首領的壓榨，財團創(chuàng)始人女兒監(jiān)禁女主套取得到光門傳送能力，學員和教授們階段性勝利，女主意外發(fā)現(xiàn)奴隸故人們。